宇宙移民与宇宙战争的歷史—宇宙世纪终結後,時光飞逝,人们迎来新的歷史Regild Century(R.C.),并開始了繁荣与和平的生活。 RC1014年,耸立大地連接地球和宇宙的轨道天梯Capital Tower(首都塔),从宇宙中為人類带来作為地球能量之源的Photon Battery,故被視為是圣地。 其守護组织Capital Guard候补生贝尔利·杰纳姆在初次飞行的時候遭到所属不明MS G-SELF的攻擊。贝尔利使用維修檢查用MS与其交战并成功捕獲。 然而贝尔利对G-SELF的驾驶者,名為アイーダ・レイハントン的宇宙海贼少女产生了某种感觉。 不满足特定条件便不会啟動的G-SELF对贝尔利产生了某种反应。 宇宙海贼和アイーダ的目的、被G-SELF選中的贝尔利的命运、令RC全體動摇的真相——这一切只不过是Reconguista的開始。